Přibližně 20 let po událostech vylíčených v Deus Ex, se svět sotva začíná obnovovat z katastrofální celosvětové krize V chaotickém období obnovy spatřuje několik náboženský a politických skupin příležitost, k přetvoření světové vlády k obrazu svému Chápou že správné kroky mohou určit směr vývoje lidské společnosti na celá příští desetiletí, až století V této technologické noční můře se zúčastníš temného boje za povstání světa z popela   Dynamická a inovativní akční adventura z pohledu první soby přináší bezprecedentní úroveň reálnosti Biotechnické modifikace dovolí hráči vidět skrz zdi, vyskočit 40 stop vysoko, uzdravit kritická zranění nebo se udělat pro radar neviditelným Podíváte se do skutečných světových lokalit, například Seattle, Antarktida a Káhira Rafinované skryté plížení, úroveň temnoty a zvuků ovlivňuje nepřátelskou ostražitost Variabilní hratelnost nabízí mnoho řešení problémů a podporuje různé styly přístupu Nenásilné řešení konfliktu, dovolí hráči vytvořit si etický postoj skrz jejich jednání Hráči je nabídnuta bezprecedentní svoboda jednání v dynamickém nelineárním příběhu, jenž obsahuje více možností řešení